À propos de la gestion du focus, un truc qui pourra peut-être t'aider: avec Paint.Net (encore un très bon logiciel léger), quand on amène la souris ("hover") vers les petites fenêtres "historique" et "outils", la fenêtre principale(skinné par TT) se retrouve avec l'apparence d'une fenêtre qui n'a pas le focus, alors que sans TT, Windows laisse le focus a la fenêtre.

je ne sais pas si ce comportement peut te servir pour la suite...